Bløddelssarkomer er blevet identificeret til at være af mere end 50 typer. De fleste af dem har en molekylær ændring, som er typisk for den type sarkom og bruges til at bekræfte diagnosen sarkom. For eksempel: Synovialt sarkom: t(X; 18) (p11.2; q11.2), Alveolar Rhabdomyosarcoma t (2:13) (q13; q14) osv. Valget af behandling afhænger af typen af sarkom. Kemoterapiens rolle er i øjeblikket der i både helbredende og avancerede kræftindstillinger.
Kemoterapiens nuværende rolle for patienter, der har lokaliseret sygdom, er ikke defineret godt, selvom der er mere accept af kemoterapi ved højrisikosarkomer som store tumorer, høje grader og kemosensitive histologier som synovialt sarkom, leiomyosarkom osv. Kemoterapi overvejes ofte i kombination (ifoscincit+ doxoruetaxel-tilfælde) Det kan især overvejes i disse 2 situationer: Når sygdommen vurderes at have høj risiko for recidiv (dvs. høj grad, dybtliggende, > 5 cm). I udvalgte tilfælde gives præoperativ kemoterapi også sammen med strålebehandling for at mindske sygdommen for at gøre den operationel. Nogle gange afgives hypertermi med kemoterapi i visse kliniske situationer.
Kemoterapi er grundpillen i behandlingen af fremskreden sygdom, da de indgivne lægemidler kommer ind i blodbanen og når kræftceller i hele kroppen. Disse lægemidler kan gives alene eller i kombination og kan gives som ambulant eller som indlagt patient med indlæggelse på hospitalet i et par dage. Kemoterapi gives i behandlingscyklusser, og kemoterapikuren består normalt af flere cyklusser givet over en bestemt periode: antallet af cyklusser afhænger af sarkomets type, sted og størrelse, og hvordan det reagerer på lægemidlerne. Det mest almindelige lægemiddelregime er doxorubicin alene eller i kombination med Ifosfamid, Docetaxel med Gemcitabin osv. De almindelige bivirkninger er lavt blodtal, opkastning, alopeci, træthed, og disse bivirkninger kan i høj grad kontrolleres med passende støttende medicin. I nogle sarkomer som f.eks. alveolær bløddel sarkom og angiogenese-lægemidler, som er rettet mod VEGF, som pazopanib, har meget god klinisk aktivitet, og patienten opnår langsigtet sygdomskontrol. Der foregår mange forsøg med sarkombehandling, da fordelen ved kemoterapi stadig ikke er optimal.