Bylo identifikováno více než 50 typů sarkomů měkkých tkání. Většina z nich má molekulární alteraci typickou pro tento typ sarkomu a používá se k potvrzení diagnózy sarkomu. Například: synoviální sarkom: t(X; 18) (p11.2; q11.2), alveolární rabdomyosarkom t(2:13) (q13; q14) atd. Volba léčby závisí na typu sarkomu. Chemoterapie v současnosti hraje roli jak v kurativní, tak i v pokročilé léčbě rakoviny.
Současná role chemoterapie u pacientů s lokalizovaným onemocněním není dobře definována, ačkoli chemoterapie je více akceptována u vysoce rizikových sarkomů, jako jsou velké nádory, nádory s vysokým stupněm malignity a chemosenzitivní histologie, jako je synoviální sarkom, leiomyosarkom atd. V takových případech se chemoterapie často zvažuje v kombinaci (ifosfamid + doxorubicin, docetaxel + gemcitabin) po operaci. Lze ji zvážit zejména v těchto dvou situacích: Pokud je onemocnění považováno za vysoce rizikové pro recidivu (tj. vysoký stupeň, hluboké usazení, > 2 cm). Ve vybraných případech se spolu s radioterapií podává také preoperační chemoterapie, aby se zmenšil rozsah onemocnění a učinil se operabilním. Někdy se v určitých klinických situacích podává hypertermie s chemoterapií.
Chemoterapie je základem léčby pokročilého onemocnění, protože podávané léky vstupují do krevního oběhu a dosahují rakovinných buněk v celém těle. Tyto léky lze podávat samostatně nebo v kombinaci a mohou být podávány ambulantně nebo hospitalizováno s hospitalizací na několik dní. Chemoterapie se podává v cyklech a chemoterapeutický režim obvykle sestává z několika cyklů podávaných během stanoveného období: počet cyklů závisí na typu, místě a velikosti sarkomu a na tom, jak reaguje na léky. Nejběžnějším léčebným režimem je doxorubicin samotný nebo v kombinaci s ifosfamidem, docetaxel s gemcitabinem atd. Mezi běžné nežádoucí účinky patří nízký krevní obraz, zvracení, alopecie, únava a tyto vedlejší účinky lze do značné míry kontrolovat pomocí vhodné podpůrné péče. U některých sarkomů, jako je alveolární sarkom měkkých partií, a angiogeneze mají léky cílené na VEGF, jako je pazopanib, velmi dobrou klinickou aktivitu a pacienti dosahují dlouhodobé kontroly onemocnění. Probíhá mnoho studií v léčbě sarkomu, protože přínos chemoterapie stále není optimální.