Yumuşak doku sarkomlarının 50'den fazla türü olduğu belirlenmiştir. Çoğu, o sarkom türüne özgü olan moleküler bir değişikliğe sahiptir ve sarkom tanısını doğrulamak için kullanılır. Örneğin: Sinovyal Sarkom: t(X; 18) (p11.2; q11.2), Alveolar Rabdomyosarkom t (2:13) (q13; q14) vb. Tedavi seçimi sarkom türüne bağlıdır. Kemoterapinin rolü şu anda hem küratif hem de ileri kanser ortamlarında vardır.
Lokalize hastalığı olan hastalar için kemoterapinin güncel rolü iyi tanımlanmamıştır, ancak büyük tümörler, yüksek dereceli ve sinovyal sarkom, leiomyosarkom gibi kemosensitif histolojiler gibi yüksek riskli sarkomlarda kemoterapi daha fazla kabul görmektedir. Bu gibi durumlarda kemoterapi genellikle ameliyattan sonra kombinasyon halinde (ifosfamid + doksorubisin, docetaxel + gemcitabine) düşünülür. Özellikle şu 2 durumda düşünülebilir: Hastalığın tekrarlama riskinin yüksek olduğu düşünüldüğünde (yani yüksek dereceli, derin yerleşmiş, > 5 cm). Seçilmiş vakalarda, hastalığı ameliyat edilebilir hale getirmek için radyoterapiyle birlikte ameliyat öncesi kemoterapi de verilir. Bazen belirli klinik durumlarda kemoterapi ile birlikte hipertermi verilir.
Kemoterapi, uygulanan ilaçların kan dolaşımına girmesi ve vücuttaki kanser hücrelerine ulaşması nedeniyle ileri hastalığın tedavisinin temelini oluşturur. Bu ilaçlar tek başlarına veya kombinasyon halinde verilebilir ve ayakta tedavi veya birkaç gün hastanede yatışla birlikte yatarak tedavi olarak verilebilir. Kemoterapi tedavi döngüleri halinde verilir ve kemoterapi rejimi genellikle belirli bir süre boyunca verilen birkaç döngüden oluşur: döngü sayısı sarkomun türüne, yerine ve boyutuna ve ilaçlara nasıl yanıt verdiğine bağlıdır. En yaygın ilaç rejimi tek başına doksorubisin veya Ifosfamid, Gemcitabine ile Docetaxel vb. kombinasyonudur. Yaygın yan etkiler düşük kan sayımı, kusma, alopesi, yorgunluktur ve bu yan etkiler uygun destekleyici bakım ilaçlarıyla büyük ölçüde kontrol altına alınabilir. Alveolar yumuşak kısım sarkomu ve pazopanib gibi VEGF'yi hedef alan anjiyogenez ilaçları gibi bazı sarkomlarda çok iyi klinik aktiviteye sahiptir ve hasta uzun vadeli hastalık kontrolüne ulaşır. Kemoterapinin faydası henüz optimum düzeyde olmadığından sarkom tedavisinde çok sayıda çalışma yürütülüyor.