Molekulárna patológia

Molekulárna patológia je oblasť patológie, ktorá využíva princípy, techniky a nástroje molekulárnej biológie, ktorá je veľmi dôležitým nástrojom pre prax presnej medicíny.

Myeloidné novotvary

• Akútna myeloidná leukémia.
• Myeloproliferatívne novotvary.
• Myelodysplastické syndrómy.
• Myelodysplastické/myeloproliferatívne neoplazmy.
• Myeloidné/lymfoidné novotvary s eozinofíliou a preskupením génov.
• Mastocytóza.

Lymfoidné novotvary

• B-lymfoblastická leukémia/lymfóm
• Chronická lymfocytová leukémia
• Novotvary plazmatických buniek
• B-bunkový lymfóm vysokého stupňa

Použitie rôznych technológií, ako je real-time PCR, fluorescenčná in situ hybridizácia (FISH), fragmentová analýza a sekvenovanie novej generácie (NGS), pomáha presne charakterizovať genetickú abnormalitu spôsobujúcu ochorenie.

• PCR umožňuje amplifikáciu fragmentov DNA na uľahčenie detekcie. PCR sa môže použiť na hľadanie určitých zmien v géne alebo chromozóme, ktoré môžu pomôcť nájsť a diagnostikovať genetický stav alebo ochorenie, ako je rakovina.
• PCR v reálnom čase začína templátom DNA/RNA (extrahovaným zo vzorky pacienta) a ciele záujmu (napr. mutácia JAK2 v myeloproliferatívnych novotvaroch alebo transkripty fúzie BCR-ABL v CML) sa mnohomiliónkrát amplifikujú, čo je možné detegovať v reálnom čase a hlásiť kvalitatívne (detegované/nezistené) alebo kvantitatívne (napr. kópie/ml).
• FISH – metóda molekulárnej cytogenetiky/laboratórna technika na detekciu a lokalizáciu špecifickej sekvencie DNA na chromozóme, pričom vzorky sú spracované tak, aby sa uľahčila väzba cieľovej DNA so sondou DNA značenou fluorochrómom, čo umožňuje následnú vizualizáciu fluorescenčným mikroskopom.
• Analýza fragmentov: Po cieľovej amplifikácii (konvenčná PCR), separácii a vizualizácii fluorescenčne značených fragmentov (DNA) na základe veľkosti (napr. Microsatellite Instability).
• NGS (Next generation sequencing) – Umožňuje simultánnu detekciu diagnosticky a prognosticky relevantných genetických zmien vo viacerých génoch, pre ktoré je dostupná cielená liečba. Test začína prípravou knižnice a výsledný templát sa klonálne amplifikuje a obohacuje, čo sa ďalej sekvenuje. Genetické zmeny sú anotované pomocou komerčne dostupného softvéru, ktorý ich spája s dostupnou relevantnou terapiou, klinickými skúškami a rizikom.

• Pevné nádory:

  10 ng vstupnej nukleovej kyseliny deteguje akcieschopné ciele v 52 génoch. Ak sa identifikuje účinný cieľ, podáva sa cielená terapia, ktorá sa zameriava na špecifické gény a proteíny, ktoré sa podieľajú na raste a prežití rakovinových buniek bez ovplyvnenia normálnych buniek. Funguje tak, že blokuje rastové signály nevyhnutné pre proliferáciu rakovinových buniek, urýchľuje ich deštrukciu a tiež znižuje tvorbu nových krvných ciev potrebných na jej prežitie. Táto terapia predĺži prežitie pacienta a zlepší celkový výsledok pacienta. Pomáha pri diagnostike sarkómov mäkkých tkanív, ako aj malobunkových nádorov tým, že odhalí charakteristickú cytogenetickú abnormalitu.

• Myeloidné novotvary:

  Od Súčasne deteguje všetky relevantné genetické abnormality naprieč 79 génmi v jedinom teste, a nie postupne. Tento test je veľmi užitočný na diagnostiku myeloidných novotvarov a ich klasifikáciu podľa odporúčaní. Poskytuje prognostické informácie o tom, či pacient bude potrebovať štandardnú liečbu alebo vysokú dávku chemoterapie alebo transplantáciu kostnej drene na trvalé vyliečenie. Pomáha tiež pri výbere pacientov na cielenú liečbu.

• Lymfoidné novotvary:

  Pomáha pri stratifikácii rizika a usmerňuje liečbu.