Molekylär patologi

Molekylär patologi är ett område inom patologi som använder principer, tekniker och verktyg från molekylärbiologi, vilket är ett mycket viktigt verktyg för utövandet av precisionsmedicin.

Myeloida neoplasmer

• Akut myeloisk leukemi.
• Myeloproliferativa neoplasmer.
• Myelodysplastiska syndrom.
• Myelodysplastiska/myeloproliferativa neoplasmer.
• Myeloid/lymfoida neoplasmer med eosinofili och genomarrangemang.
• Mastocytos.

Lymfoida neoplasmer

• B-lymfoblastisk leukemi/lymfom
• Kronisk lymfocytisk leukemi
• Plasmacellsneoplasmer
• Höggradigt B-cellslymfom

Genom att använda olika tekniker som realtids-PCR, fluorescens in situ-hybridisering (FISH), fragmentanalys och nästa generations sekvensering (NGS) kan man noggrant karakterisera den genetiska avvikelse som orsakar sjukdomen.

• PCR möjliggör amplifiering av DNA-fragment för att underlätta detektion. PCR kan användas för att leta efter vissa förändringar i en gen eller kromosom, vilket kan hjälpa till att hitta och diagnostisera ett genetiskt tillstånd eller en sjukdom, såsom cancer.
• Realtids-PCR börjar med DNA/RNA-mall (extraherad från patientprov) och de intressanta målen (t.ex. JAK2-mutation i myeloproliferativa neoplasmer eller BCR-ABL-fusionstranskript i KML) amplifieras många miljoner gånger, vilket kan detekteras i realtid och rapporteras kvalitativt (detekterat/ej detekterat) eller kvantitativt (t.ex. kopior/ml).
• FISH – molekylär cytogenetisk metod/laboratorieteknik för att detektera och lokalisera en specifik DNA-sekvens på en kromosom. Där proverna bearbetas för att underlätta bindningen av mål-DNA med prob-DNA märkt med fluorokrom, vilket möjliggör efterföljande visualisering med fluorescensmikroskop.
• Fragmentanalys: Efter målamplifiering (konventionell PCR), separation och visualisering av fluorescensmärkta fragment (DNA) baserat på storlek (t.ex. mikrosatellitinstabilitet).
• NGS (Next generation sequencing) – Möjliggör samtidig detektion av diagnostiskt och prognostiskt relevanta genetiska förändringar i flera gener för vilka riktad terapi finns tillgänglig. Analysen börjar med biblioteksberedning och den resulterande mallen klonalt amplifieras och berikas, vilken sedan sekvenseras ytterligare. Genetiska förändringar annoteras med kommersiellt tillgänglig programvara som kopplar den till tillgänglig relevant terapi, kliniska prövningar och risk.

• Fasta tumörer:

  10 ng av inmatad nukleinsyra detekterar verkningsbara mål över 52 gener. Om ett verkningsbart mål identifieras ges riktad behandling som riktar sig mot specifika gener och proteiner som är involverade i cancercellers tillväxt och överlevnad utan att påverka de normala cellerna. Den fungerar genom att blockera tillväxtsignaler som är avgörande för cancercellernas proliferation, accelererar deras nedbrytning och minskar även produktionen av nya blodkärl som krävs för deras överlevnad. Denna behandling förlänger patientens överlevnad och förbättrar patientens övergripande resultat. Hjälper till vid diagnos av mjukdelssarkom samt små rundcelliga tumörer genom att upptäcka den karakteristiska cytogenetiska avvikelsen.

• Myeloida neoplasmer:

  Detekterar samtidigt alla relevanta genetiska avvikelser över 79 gener i en enda analys snarare än sekventiellt. Detta test är mycket användbart för diagnos av myeloida neoplasmer och dess klassificering enligt riktlinjernas rekommendation. Det ger prognostisk information om huruvida patienten kommer att behöva standardbehandling eller högdos kemoterapi eller benmärgstransplantation för permanent botning. Det hjälper också till att välja patienter för riktad behandling.

• Lymfoida neoplasmer:

  Hjälper till vid riskstratifiering och vägleder behandling.