Moleculaire pathologie

Moleculaire pathologie is een vakgebied pathologie die gebruikmaakt van de principes, technieken en hulpmiddelen van de moleculaire biologie, een uiterst essentieel hulpmiddel voor de praktijk van precisiegeneeskunde.

Indicaties

• Myeloïde neoplasmata
  • Acute myeloïde leukemie.

  • Myeloproliferatieve neoplasmata.

  • Myelodysplastische syndromen.

  • Myelodysplastische/myeloproliferatieve neoplasmata.

  • Myeloïde/lymfoïde neoplasmata met eosinofilie en genherschikking.

  • Mastocytose.

• Lymfoïde neoplasmata
• B-lymfoblastische leukemie/lymfoom

• Chronische lymfatische leukemie

• Neoplasmata van plasmacellen

• Hooggradig B-cellymfoom

procedures

Door gebruik te maken van verschillende technologieën, zoals real-time PCR, fluorescentie in situ hybridisatie (FISH), fragmentanalyse en Next Generation Sequencing (NGS), kan de genetische afwijking die de ziekte veroorzaakt, nauwkeurig worden gekarakteriseerd.

• PCR maakt het mogelijk om DNA-fragmenten te amplificeren om detectie te vergemakkelijken. PCR kan worden gebruikt om te zoeken naar bepaalde veranderingen in een gen of chromosoom, wat kan helpen bij het vinden en diagnosticeren van een genetische aandoening of een ziekte, zoals kanker.

• Realtime PCR begint met een DNA/RNA-template (geëxtraheerd uit het patiëntmonster) en de doelen van belang (bijv. JAK2-mutatie in myeloproliferatieve neoplasmata of BCR-ABL-fusietranscripten in CML) worden vele miljoenen keren versterkt, wat in realtime kan worden gedetecteerd en kwalitatief (gedetecteerd/niet gedetecteerd) of kwantitatief (bijv. kopieën/ml) kan worden gerapporteerd.

• FISH – moleculaire cytogenetische methode/laboratoriumtechniek voor het detecteren en lokaliseren van een specifieke DNA-sequentie op een chromosoom. De monsters worden verwerkt om de binding van doel-DNA met het probe-DNA gelabeld met fluorochroom te vergemakkelijken, wat daaropvolgende visualisatie door fluorescentiemicroscoop mogelijk maakt.

• Fragmentanalyse: Na doelamplificatie (conventionele PCR) worden de fluorescent gelabelde fragmenten (DNA) gescheiden en zichtbaar gemaakt op basis van grootte (bijv. microsatellietinstabiliteit).

• NGS (volgende generatie sequencing) – Maakt gelijktijdige detectie mogelijk van diagnostisch en prognostisch relevante genetische veranderingen in meerdere genen waarvoor gerichte therapie is beschikbaar. De assay start met bibliotheekvoorbereiding en de resulterende template wordt klonaal versterkt en verrijkt, die vervolgens verder worden gesequenced. Genetische veranderingen worden geannoteerd met behulp van commercieel beschikbare software, die deze koppelt aan beschikbare relevante therapie, klinische proeven en risicostratificatiedetails.

Voordelen

• Solide tumoren:
  • Vanaf 10 ng input nucleïnezuur detecteert het bruikbare targets in 52 genen. Als een bruikbaar target wordt geïdentificeerd, wordt er een gerichte therapie gegeven, die zich richt op specifieke genen en eiwitten die betrokken zijn bij de groei en overleving van kankercellen zonder de normale cellen te beïnvloeden. Het werkt door de groeisignalen te blokkeren die essentieel zijn voor de proliferatie van kankercellen, versnelt de vernietiging ervan en vermindert ook de productie van nieuwe bloedvaten die nodig zijn voor de overleving. Deze therapie zal de overleving van de patiënt verlengen en de algehele uitkomst van de patiënt verbeteren.
  • Helpt bij de diagnose van wekedelensarcomen en kleine rondcellige tumoren door de karakteristieke cytogenetische afwijking te detecteren.
• Myeloïde neoplasmata:
  • Detecteert gelijktijdig alle relevante genetische afwijkingen in 79 genen in één enkele test in plaats van sequentieel. Deze test is erg nuttig voor de diagnose van myeloïde neoplasmata en de classificatie ervan volgens de richtlijnaanbeveling. Het biedt prognostische informatie over de vraag of de patiënt standaardbehandeling of chemotherapie met hoge dosering nodig heeft of beenmerg transplantatie voor permanente genezing. Het helpt ook bij het selecteren van patiënten voor gerichte therapie.
• Lymfoïde neoplasmata:
  • Helpt bij risicostratificatie en stuurt de behandeling.