बहुतेक बालपणातील कर्करोगांना ज्ञात कारण नसते. बालपणातील सर्व कर्करोगांपैकी एक दशांश पेक्षा कमी कर्करोग उत्परिवर्तनामुळे होतात जे एका पिढीकडून दुसऱ्या पिढीकडे जाऊ शकतात. बालपणातील कर्करोग दुर्मिळ असतात आणि प्रौढ कर्करोगापेक्षा ते अधिक आक्रमक असतात.
बहुतेक बालपण कर्करोग अनेक विशिष्ट प्रकारांपैकी एकात येतात, खाली सूचीबद्ध केल्याप्रमाणे: