لا يوجد سبب معروف لمعظم حالات سرطان الأطفال. أقل من عُشر حالات سرطان الأطفال ناجمة عن طفرة يمكن أن تنتقل من جيل إلى جيل. سرطان الأطفال نادر ويميل إلى أن يكون أكثر عدوانية من سرطان البالغين.
تنقسم معظم سرطانات الأطفال إلى عدة أنواع محددة، كما هو موضح أدناه: